Συντάκτης: andrey

The Atlantic δημοσίευσε ένα άρθρο με τον τίτλο “Η επιστημονική δημοσίευση είναι ξεπερασμένη” που είναι εικονογραφημένο με το φλεγομένο χειρόγραφο. Ο παρακάτω υπότιτλος είναι λίγο καθησυχαστικός – “Εδώ είναι το επόμενο.”

Τι θα ακολουθήσει; Που πάμε; Το άρθρο, που γράφτηκε από τον πρώην συντάκτη του The Atlantic, James Somers, δεν σηματοδοτεί το θάνατο μιας επιστημονικής έκδοσης, όπως υποδηλώνει γρήγορα ο τίτλος. Προτείνει ότι η έρευνα που βασίζεται σε χαρτί καθίσταται ξεπερασμένη. Ο Somers υποστηρίζει ότι η εκτύπωση περιοδικών και η δημοσίευση άρθρων PDF σε χαρτί στο Διαδίκτυο δεν επιτρέπει τη δυναμική παρουσίαση της έρευνας που απαιτείται για συγγραφείς και αναγνώστες. Κάνει την ερώτηση: “Τι θα έχετε αν δημιουργήσετε ένα επιστημονικό άρθρο από το μηδέν σήμερα;” Το άρθρο ασχολείται με μια εναλλακτική έκδοση μιας επιστημονικής έκδοσης, που δημιουργήθηκε χρησιμοποιώντας τη λεγόμενη υπολογιστική μορφή του computational notebook.

Το αν το computational notebook θα γίνει η κύρια μορφή έκδοσης δεν έχει ακόμη καθοριστεί. Όπως σημειώνει ο Somers, αυτό θα απαιτήσει δραματικές αλλαγές στην ακαδημαϊκή έρευνα και το εκδοτικό περιβάλλον γενικά. Και είναι το PDF τόσο παλιό; Συζητήσαμε τους περιορισμούς των αρχείων PDF στο πρώτο μέρος αυτού του άρθρου. Η μορφή PDF δεν υποστηρίζει αρχεία πολυμέσων και τέτοιο περιεχόμενο είναι πολύ δύσκολο να διαβαστεί κανείς από την οθόνη των κινητών συσκευών. Αλλά τα PDF έχουν τα πλεονεκτήματά τους. Τα αρχεία PDF είναι η καλύτερη μορφή για επιστήμονες που προτιμούν να διαβάζουν φυσικά αντίγραφα άρθρων, καθώς αυτή η μορφή τους επιτρέπει να εκτυπώνουν το υλικό που θέλουν και να είναι σίγουροι ότι το αντίγραφο θα είναι πανομοιότυπο με το πρωτότυπο. Τα αρχεία PDF μπορούν επίσης να αποθηκευτούν σε μορφή e-book, καθιστώντας τα εύκολα στη μεταφορά. Υπάρχουν λοιπόν λόγοι να μην ξεγράφει κανείς από τη λίστα τα αρχεία PDF.

Ωστόσο, αφήνοντας κατά μέρος τη συζήτηση σχετικά με τη χρησιμότητα των αρχείων PDF, καθίσταται σαφές ότι η χρήση της διαδικτυακής μορφής εκδόσεων με βάση το χαρτί δεν παρέχει την καλύτερη δυνατή εμπειρία χρήστη για αναγνώστες ανθρώπων ή για έναν αυξανόμενο αριθμό αναγνωστών μηχανών (μηχανές αναζήτησης, αποθετήρια, αθροιστές κ.λπ.). Τα μηχανήματα πρέπει να είναι σε θέση να επεξεργάζονται πληροφορίες σε γλώσσες σήμανσης υπολογιστή και οι επιστήμονες πρέπει να είναι σε θέση να προσθέτουν δυναμικά στοιχεία σε έγγραφα, να αναλύουν δεδομένα και να διαβάζουν απλά άρθρα στις κινητές συσκευές τους χωρίς να διαμαρτύρονται για ταλαιπωρία.

Οι αλλαγές που εισάγονται σε περιοδικά σε διάφορους κλάδους που μπορούν να βελτιώσουν σημαντικά τη διαδικτυακή διαθεσιμότητα και χρησιμότητα των επιστημονικών δημοσιεύσεων είναι η δημοσίευση άρθρων σε HTML και πλήρες κείμενο XML. Η δημιουργία αυτών των πρόσθετων μορφών άρθρου δεν απαιτεί απαραίτητα πρόσθετα στάδια παραγωγής. Χρησιμοποιώντας τις διαδικασίες ψηφιακής πληκτρολόγησης, τα περιοδικά μπορούν να δημιουρούν ταυτόχρονα πολλά αρχεία άρθρων. Πως το σύστημα Hephaestus, που αναπτύχθηκε από το RADS, σας επιτρέπει να επισημάνετε επιστημονικά άρθρα για προσθήκη σε διάφορα αποθετήρια, μπορείτε να το βρείτε εδώ.

Γιατί χρειάζονται άλλοι τύποι αρχείων εκτός από το PDF;

Η αναζήτηση είναι ο ακρογωνιαίος λίθος της επιστημονικής έρευνας

Ας αναλύσουμε πρώτα ένα από τα μεγαλύτερα προβλήματα με τη δημοσίευση σε PDF – το περιορισμένο περιεχόμενο αναζήτησης. Στις ψηφιακές εκδόσεις, η αναζήτηση είναι το θεμέλιο των πάντων, ο ακρογωνιαίος λίθος της επιστημονικής γνώσης. Η έκθεση του Renew Publishing Consultants ‘2018 που ονομάζεται «How Readers Discovered Content in Scientific Publications» αναφέρει ότι «οι ακαδημαϊκοί ερευνητές (ομάδα χωρίς μαθητές) κατατάσσουν τις μηχανές αναζήτησης ως τον πιο σημαντικό πόρο για την εύρεση επιστημονικών άρθρων». Η αναφορά περιλαμβάνει επιστημονικές βάσεις δεδομένων (π.χ. το PubMed Central), καθώς και πιο γενικές μηχανές επιστημονικής αναζήτησης όπως το Google Scholar.

Υπάρχουν δύο κύρια μοντέλα για το πώς τα αποθετήρια και οι μηχανές αναζήτησης συλλέγουν και επεξεργάζονται πληροφορίες για να μάθουν τι να επιστρέψουν στα αποτελέσματα αναζήτησης: (1) τα μεταδεδομένα και καταθέσεις περιεχομένου και (2) οι ανιχνευτές. Και στα δύο αυτά σενάρια, το PDF δεν συμμορφώνεται με τα πρότυπα. Σε περίπτωση ενσωμάτωσης μεταδεδομένων και αποθήκευσης περιεχομένου, τα αρχεία PDF δεν είναι αναγνώσιμα από υπολογιστή. Οι περισσότερες βάσεις δεδομένων απαιτούν μεταβίβαση μεταδεδομένων και περιεχομένου σε αυτές σε XML συμβατό με το JATS. Τα περιοδικά που δεν δημιουργούν αρχεία XML με δυνατότητα ανάγνωσης από μηχανή μπορούν να εισάγουν μη αυτόματα δεδομένα σε ορισμένα ευρετήρια, αλλά αυτή είναι μια κουραστική διαδικασία που δεν επιτρέπει όλες τις πληροφορίες που απαιτούνται για την αποτελεσματική επεξεργασία των δεδομένων.

Στην περίπτωση μηχανών αναζήτησης που βασίζονται σε προγράμματα ανίχνευσης μηχανών αναζήτησης, τα αρχεία PDF είναι επίσης το πρόβλημα. Αν και μπορούν να ευρετηριαστούν από πολλές μηχανές αναζήτησης, το περιεχόμενό τους δεν βελτιστοποιείται για αναζήτηση για διάφορους λόγους. Πρώτον, τα άρθρα PDF συχνά δεν διαθέτουν επαρκή μεταδεδομένα HTML επειδή πολλά περιοδικά δεν τα τοποθετούν σε σελίδες ιστότοπου αλλά συνδέονται απευθείας με το ίδιο το PDF. Για να ευρετηριάσουν αποτελεσματικά τους ιστότοπους περιοδικών, τα προγράμματα ανίχνευσης πρέπει να είναι σε θέση να βρουν κάθε άρθρο περιοδικού σε ξεχωριστή ιστοσελίδα με τα μεταδεδομένα άρθρου σε επίπεδο HTML που σχετίζονται με αυτό. Τα αρχεία PDF από μόνα τους δεν παρέχουν στους σαρωτές τα μεταδεδομένα που χρειάζονται.

Για τη βελτιστοποίηση άρθρων για μηχανές αναζήτησης, τα περιοδικά πρέπει να δημοσιεύουν κάθε ένα από τα άρθρα τους σε μια συγκεκριμένη ιστοσελίδα άρθρου που περιλαμβάνει τα βιβλιογραφικά μεταδεδομένα σε επίπεδο HTML. Αυτή είναι στην πραγματικότητα μια βασική απαίτηση για την εγγραφή των περιοδικών στο Google Scholar. Τα περιοδικά μπορούν να εκπληρώσουν αυτήν την απαίτηση έχοντας ξεχωριστές ιστοσελίδες για εκδόσεις PDF κάθε άρθρου, ιδανικά χρησιμοποιώντας ένα ενσωματωμένο πρόγραμμα προβολής PDF στην ιστοσελίδα, αντί να συνδέονται οι σελίδες άρθρων με αρχεία PDF. Η εμφάνιση άρθρων PDF σε ιστοσελίδες βοηθά τις μηχανές αναζήτησης να «κατανοήσουν» πώς σχετίζονται με άλλο περιεχόμενο στον ιστότοπο και αυξάνει την πιθανότητα ανίχνευσης πρόσθετων σελίδων.

Ωστόσο, ακόμη και όταν τοποθετούνται σε ξεχωριστές ιστοσελίδες, τα αρχεία PDF ενδέχεται να περιέχουν περιορισμούς συνδέσμων. Μπορεί να είναι κουραστικό να προσθέσετε συνδέσμους με δυνατότητα κλικ στα αρχεία PDF, ενώ το HTML είναι πιο βολικό για την προσθήκη συνδέσμων με δυνατότητα κλικ σε κείμενο. Τα άρθρα HTML βελτιώνουν επίσης την εμπειρία χρήστη όσον αφορά συνδέσμους. Επιτρέπουν στους χρήστες να ανοίγουν συνδέσμους σε ξεχωριστές καρτέλες διατηρώντας παράλληλα τον χώρο ανάγνωσής τους στο άρθρο. Τα αρχεία PDF συχνά ανοίγουν συνδέσμους σε μία καρτέλα, με αποτέλεσμα ο αναγνώστης να μεταβεί σε άλλη σελίδα και να χάσει τη θέση που διάβαζε πριν.

Ο επόμενος, αλλά όχι λιγότερο σοβαρός περιορισμός των αρχείων PDF στη σύγχρονη αναζήτηση είναι η έλλειψη ανταπόκρισης για φορητές συσκευές. Σήμερα, πολλές μηχανές αναζήτησης, συμπεριλαμβανομένης της Google, μετακινούνται στην ευρετηρίαση από κινητές συσκευές. Το πρόγραμμα ανίχνευσης ευρετηριάζει και κατατάσσει περιεχόμενο φιλικό προς κινητά σε σχέση με περιεχόμενο που δεν είναι κατάλληλο για κινητά. Επομένως, η βελτιστοποίηση της έκδοσης για ανάγνωση από κινητές συσκευές είναι το κλειδί για την ανταγωνιστικότητά της.

Οι αναγνώστες γίνονται πιο κινητοί

Εκτός από την αναζήτηση, υπάρχουν επίσης τα σαφή οφέλη για τους αναγνώστες όταν γράφουν άρθρα σε HTML φιλικό προς κινητά. Καθώς η χρήση κινητής τηλεφωνίας αυξάνεται στο ευρύ κοινό, αυξάνεται επίσης στον ακαδημαϊκό χώρο. Η έκθεση του 2015 «Πως οι αναγνώστες βρίσκουν περιεχόμενο σε επιστημονικές δημοσιεύσεις» διαπίστωσε ότι οι ερευνητές συνεχίζουν να χρησιμοποιούν κυρίως επιτραπέζιους και φορητούς υπολογιστές για έρευνα και συγγραφή, αλλά υπήρξε μια σαφής αύξηση στη χρήση κινητών συσκευών από ερωτηθέντες σε διάφορους κλάδους. … Αυτό ισχύει ιδιαίτερα σε χώρες χαμηλού εισοδήματος, όπου ο αριθμός των χρηστών κινητών συσκευών έχει σχεδόν διπλασιαστεί. Καθώς ολόκληρος ο κόσμος γίνεται πιο κινητός, οι επιστήμονες πρέπει να έχουν πρόσβαση στην έρευνα γρήγορα και εύκολα. Και για χώρες χαμηλού εισοδήματος, οι κινητές συσκευές είναι συχνά πιο προσιτές από τους υπολογιστές.

Οι ευκαιρίες για βελτίωση της εμπειρίας ανάγνωσης και της χρήσης

Η δημοσίευση των αρχείων PDF από μόνη της περιορίζει τη χρήση νέων εμπειριών ανάγνωσης και άρθρων στο Διαδίκτυο. Για παράδειγμα, οι ορισμένοι εκδότες και βάσεις δεδομένων περιεχομένου αρχίζουν να εισάγουν μεταδεδομένα εμπλουτισμένων άρθρων. Τα εμπλουτισμένα μεταδεδομένα περιλαμβάνουν στοιχεία σημασιολογικού περιεχομένου που μπορούν να βοηθήσουν τις βάσεις δεδομένων όχι μόνο να καταλάβουν ποιο είναι το περιεχόμενο, αλλά και τι αφορά. Σε μια πρόσφατη συνέντευξή του, ο Jabin White, αντιπρόεδρος της διαχείρισης περιεχομένου στο JSTOR και στο Portico, έδωσε μια υπέροχη ομιλία για πλούσια μεταδεδομένα. Όπως σημείωσε, η ύπαρξη πλήρους κειμένου XML αποτελεί σημαντική προϋπόθεση για τους εκδότες, τα αποθετήρια και τους διανομείς περιεχομένου όπως το JSTOR να δημιουργήσουν αποτελεσματικά πλούσια μεταδεδομένα.

Εκτός από την υποστήριξη της δημιουργίας πλούσιων μεταδεδομένων, τα αρχεία XML πλήρους κειμένου είναι επίσης πιο βολικά για ανάλυση κειμένου και δεδομένων, όπου χρησιμοποιούνται διαδικτυακά σενάρια ή εργαλεία μηχανικής μάθησης για την ανάκτηση πληροφοριών άρθρου. Για παράδειγμα, ένας επιστήμονας μπορεί να χρησιμοποιήσει ανάλυση κειμένου και δεδομένων για να συντάξει μια συλλογή άρθρων που συνδέονται με ένα συγκεκριμένο θέμα ή για να αναλύσει σχετικά σύνολα δεδομένων σε όλα τα άρθρα. Νέα εργαλεία μηχανικής εκμάθησης έχουν δείξει ότι ενώ είναι δυνατή η ανάλυση αρχείων PDF, είναι τεχνικά πολύ δύσκολο. Για παράδειγμα, το Scite αναλύει την αναφορά των άρθρων για να προσδιορίσει εάν η έρευνα υποστηρίζει ή έρχεται σε αντίθεση μεταξύ τους. Για το Scite και άλλα εργαλεία μηχανικής εκμάθησης, η μετακίνηση όλων των άρθρων σε μορφή αναγνώσιμη από μηχανή θα είναι ένα σημαντικό βήμα προς τα εμπρός. Σήμερα, πρέπει επίσης να αναλύσουν το PDF, καθώς τα αρχεία PDF είναι η κυρίαρχη μορφή δημοσίευσης.

Η ευέλικτη εμπειρία ανάγνωσης για διαφορετικές ανάγκες

Όταν εξετάζουμε τα πλεονεκτήματα και τα μειονεκτήματα του PDF, καθώς και άλλους τύπους αρχείων με δυνατότητα ανάγνωσης από ανθρώπινο και μηχάνημα, καθίσταται προφανές ότι κάθε τύπος αρχείου ικανοποιεί διαφορετικές ανάγκες. Το αρχείο PDF παραμένει η επιλογή για περιοδικά, η οποία μπορεί να δώσει στους αναγνώστες τη δυνατότητα να εκτυπώνουν εύκολα αντίγραφα των άρθρων. Αλλά για την αποτελεσματικότητα της διαδικασίας παραπομπής και της επεξεργασίας πληροφοριών, η δημοσίευση περιοδικών σε HTML και XML είναι υψίστης σημασίας.

Το Διαδίκτυο βρίσκεται σε κατάσταση ροής: νέα δεδομένα εμφανίζονται εδώ κάθε λεπτό και τα παλιά δεδομένα μερικές φορές αλλάζουν ή μετακινούνται. Ενώ το πλεονέκτημα της δημοσίευσης επιστημονικών αποτελεσμάτων στο Διαδίκτυο είναι ότι μπορούν να ενημερώνονται ανά πάσα στιγμή, η μετακίνηση ή η αλλαγή τέτοιων δεδομένων μπορεί επίσης να δυσχεράνει την παρακολούθηση διαφορετικών εκδόσεων επιστημονικών άρθρων. Εδώ μπαίνουν στο παιχνίδι ψηφιακά αναγνωριστικά αντικειμένων ή το DOI.

Το DOI είναι ένας μόνιμος σύνδεσμος προς ένα αντικείμενο στο Διαδίκτυο, που αποτελείται από ένα πρόθεμα οργανισμού και ένα μοναδικό επίθημα. Η προσθήκη ενός DOI σε όλα τα άρθρα στο περιοδικό σας διασφαλίζει ότι οι αναγνώστες θα μπορούν να γνωρίζουν την επίσημη έκδοση ενός άρθρου με βοήθεια του DOI, ακόμη και αν πρέπει να αλλάξετε τη διεύθυνση ιστού του περιοδικού σας ή εάν υπάρχουν συγγραφείς που διανέμουν διαφορετικές εκδόσεις των άρθρων τους (pre-print), οι αναγνώστες μπορούν να μάθουν την επίσημη έκδοση του άρθρου με βοήθεια του DOI. Κάθε DOI περιέχει βιβλιογραφικά και άλλα μεταδεδομένα, συμπεριλαμβανομένης της πιο σχετικής διεύθυνσης URL ή της τοποθεσίας ενός δεδομένου αντικειμένου στο Διαδίκτυο.

Πώς μπορείτε να λάβετε το DOI για άρθρα στο περιοδικό σας; Και πώς θα ωφελήσει το περιοδικό; Τι πρέπει να γνωρίζετε για να αρχίσετε να χρησιμοποιείτε το DOI στο περιοδικό σας; Εγγραφή του DOI με το RADS

Το περιοδικό σας μπορεί εύκολα να αρχίσει να εκχωρεί DOI για επιστημονικά άρθρα και άλλα δεδομένα. Για να ξεκινήσει η εκχώρηση του DOI για άρθρα, ο οργανισμός πρέπει να συνάψει τη συμφωνία με το RADS. Μπορείτε να συμπληρώσετε μια αίτηση στο διαδίκτυο. Αφού συμπληρώσετε και υποβάλετε την αίτηση, το RADS θα την εξετάσει και θα σας στείλει υπογεγραμμένη συμφωνία.

Αφού ο εκδότης ή ο συντάκτης του περιοδικού υπογράψει τη συμφωνία και πληρώσει την αρχική ετήσια χρέωση, το RADS εκχωρεί στον εκδότη ένα μοναδικό πρόθεμα το οποίο είναι το πρώτο μέρος του DOI, καθώς και το όνομα χρήστη και τον κωδικό πρόσβασης για το σύστημα σήμανσης δεδομένων για την καταχώριση του DOI που ονομάζεται το Hephaestus.

Έχοντας λάβει ένα πρόθεμα, οι εκδότες μπορούν να δημιουργήσουν τα δικά τους επίθημα για κάθε άρθρο χρησιμοποιώντας τις συστάσεις του RADS ή μπορούν να τα δημιουργήσουν στο σύστημα Hephaestus. Αυτό θα εκχωρήσει ένα μοναδικό DOI σε κάθε άρθρο. Συνιστούμε τη χρήση σύντομων DOI καθώς θα είναι ορατά και θα εμφανίζονται στη σελίδα του άρθρου. Στη συνέχεια, πρέπει να δημιουργήσετε αρχεία μεταδεδομένων για κάθε άρθρο που περιλαμβάνει τη διεύθυνση URL, το DOI και άλλα βασικά μεταδεδομένα, όπως το ORCID συγγραφέων, η βιβλιογραφία, το συνδέσμος πλήρους κειμένου και οι πληροφορίες άδειας. Το σύστημα Hephaestus θα σας επιτρέψει να επισημάνετε όλα τα απαραίτητα μεταδεδομένα για την εγγραφή του DOI και να δημιουργήσετε αρχεία. Αυτά τα αρχεία πρέπει στη συνέχεια να μεταφορτωθούν στο παγκόσμιο αποθετήριο των DOI. Μόλις αυτές οι πληροφορίες βρίσκονται στο αποθετήριο, το περιεχόμενο θα καταχωρηθεί και ο σύνδεσμος DOI θα είναι άμεσα διαθέσιμος και θα γίνει μέρος του παγκόσμιου δικτύου επιστημονικών συνδέσμων – ένα δίκτυο με περισσότερα από 160 εκατομμύρια αρχεία επιστημονικών δεδομένων.

Για τεχνολογικά ενημερωτικά περιοδικά που χρησιμοποιούν τις πλατφόρμες δημοσίευσης, μπορείτε να αυτοματοποιήσετε τη διαδικασία εγγραφής του DOI για νέα άρθρα.

Εκτός από την εκχώρηση ενός DOI σε ένα άρθρο, τα περιοδικά μπορούν να λαμβάνουν τα DOI για ένα περιοδικό και τέτοια δεδομένα άρθρων όπως εικόνες, πίνακες κ.λπ. Δεδομένου ότι οι επιστήμονες τείνουν να αναζητούν μεμονωμένα άρθρα στο Διαδίκτυο, αντί για περιοδικά, τα DOI για άρθρα παραμένουν βασικά.

Η διεύθυνση URL του αντικειμένου στο οποίο λαμβάνεται το DOI πρέπει να είναι πάντα έγκυρο.

Ένα από τα πιο σημαντικά σημεία που πρέπει να θυμάστε όταν πρόκειται για το DOI είναι η συνάφεια των μεταδεδομένων του DOI. Οι εκδότες είναι υπεύθυνοι για την εισαγωγή των μεταδεδομένων για τα οποία καταγράφονται τα DOI.

Δεν πρέπει να ξεχάσετε τα DOI σας μετά την εγγραφή τους. Εάν το περιεχόμενο μετακινηθεί κάπου στο διαδίκτυο και δεν ενημερώσετε τη διεύθυνση URL του άρθρου στα μεταδεδομένα, το DOI δεν θα λειτουργήσει και οι ερευνητές θα συναντήσουν απογοητευτικούς νεκρούς συνδέσμους.

Είναι απαραίτητο να ενημερώσετε το DOI του περιοδικού σας εάν μετακινήσετε άρθρα σε διαφορετική διεύθυνση URL. Επιπλέον, οι ενημερώσεις είναι πάντα ευπρόσδεκτες: για παράδειγμα, όταν υπάρχουν διορθώσεις ή είναι διαθέσιμα πρόσθετα μεταδεδομένα, όπως αναγνωριστικά του οργανισμού επιχορήγησης έρευνας, σύνδεσμοι ή πληροφορίες άδειας (το RADS σάς επιτρέπει να προσθέτετε τέτοιες πληροφορίες κατά την εγγραφή ενός DOI για ένα άρθρο).

Είναι πιθανό ένα περιοδικό να αλλάξει τον εκδότη ή την πλατφόρμα εκδόσεών του, ως αποτέλεσμα του οποίου θα αλλάξει και η διεύθυνση URL των άρθρων για τα οποία λαμβάνονται DOI. Επομένως, είναι πολύ σημαντικό το περιοδικό να έχει το δικό του πρόθεμα του DOI. Εάν πολλοί διαφορετικοί οργανισμοί χρησιμοποιούν το ίδιο πρόθεμα του DOI για περιοδικά, θα υπάρξει νομική διένεξη σχετικά με τα δικαιώματα προθέματος και τα καταχωρημένα μεταδεδομένα DOI. Από αυτήν την άποψη, πρέπει να είστε πολύ προσεκτικοί σχετικά με την εταιρεία με την οποία εγγράφετε το DOI και να βεβαιωθείτε ότι το πρόθεμα του DOI χρησιμοποιείται μόνο από τον οργανισμό σας.

Τα οφέλη από την προσθήκη του DOI για επιστημονικά άρθρα

Το κύριο πλεονέκτημα της καταχώρησης του DOI για επιστημονικά άρθρα είναι η αύξηση της προβολής τους. Λόγω του γεγονότος ότι τα σύγχρονα συστήματα βιβλιοθηκών βασίζονται στην αναζήτηση μεταδεδομένων, τόσο περισσότερα μεταδεδομένα παρέχει ένας εκδότης κατά την εγγραφή ενός άρθρου DOI, τόσο μεγαλύτερη είναι η προβολή του για άλλους ερευνητές.

Για νέες επιστημονικές δημοσιεύσεις που αναζητούν τους αναγνώστες, τους συγγραφείς και που χτίζουν τη φήμη τους, η εγγραφή ενός DOI όχι μόνο θα βοηθήσει να καταστήσει τα άρθρα της έκδοσης ορατά στην επιστημονική κοινότητα, αλλά και να αποδείξει ότι η έκδοση συμμορφώνεται με τα υψηλότερα διεθνή πρότυπα. Αυτό είναι ιδιαίτερα σημαντικό για εκείνα τα περιοδικά που επιτρέπουν στους συγγραφείς να δημοσιεύουν εκτυπωμένες εκδόσεις άρθρων σύμφωνα με τις πολιτικές του Sherpa-Romeo, καθώς το DOI θα υποδείξει με σαφήνεια ποια έκδοση του άρθρου είναι επίσημη και μπορεί να αναφέρεται.

Η εγγραφή του DOI σχετίζεται επίσης στενά με τον προσδιορισμό των συγγραφέων, ένα επείγον πρόβλημα της επιστημομετρίας. Το πρόγραμμα Hephaestus σας επιτρέπει να καθορίσετε το ORCID κατά την εγγραφή του DOI. Αυτό επιτρέπει σε έναν εγγεγραμμένο ORCID συγγραφέα να δει τον κωδικό ενός δημοσιευμένου άρθρου και να απαριθμήσει όλα τα άρθρα του σε ένα μέρος, διευκολύνοντας τη λήψη επιχορηγήσεων και την εύρεση εργασίας.

Γιατί πρέπει οι εκδότες επιστημονικών περιοδικών να στραφούν σε μορφές αναγνώσιμες από μηχανή και πώς αυτό θα επηρεάσει την ευρετηρίαση περιοδικών σε διεθνή επιστημονικά αποθετήρια;
Οι επιστημονικές βάσεις δεδομένων όπως το DOAJ, το SCOPUS, το WoS, το Pub-Med, το Google Scholar κ.λπ. είναι μερικά από τα κύρια εργαλεία που χρησιμοποιούν οι επιστήμονες για τη διεξαγωγή ερευνών. Αυτοί οι εικονικοί θησαυροί πληροφοριών φαίνεται να “κατανοούν” το περιεχόμενο που περιέχουν και μπορούν να απαντήσουν σε ερωτήματα αναζήτησης σε δευτερόλεπτα.
Φυσικά, τα αποθετήρια δεν μπορούν να «διαβάζουν» ένα ανθρώπινο κείμενο (τουλάχιστον όχι ακόμα!). Επεξεργάζονται το περιεχόμενο χρησιμοποιώντας πληροφορίες που είναι διαθέσιμες σε γλώσσες σήμανσης που διαβάζονται από μηχανή ή σε κώδικα υπολογιστή. Οι εκδότες περιοδικών που θέλουν τα άρθρα τους να εμφανίζονται στις κατάλληλες βάσεις δεδομένων πρέπει να τους παρέχουν πληροφορίες σχετικά με το άρθρο σε μηχαναγνώσιμη μορφή.
Εάν δημοσιεύετε τα άρθρα περιοδικών μόνο σε μορφή PDF, χάνετε πολύτιμες ευκαιρίες ευρετηρίου. Ας σκάψουμε βαθύτερα:
• πώς τα αποθετήρια επεξεργάζονται πληροφορίες
• οι τρόποι για να δημιουργήσετε μηχαναγνώσιμα αρχεία άρθρων και πως να τα στείλει κανείς σε βάσεις δεδομένων
• JATS Compliant XML – η τυπική μορφή ευρετηρίασης

Τα αποθετήρια δέχονται πληροφορίες σε μορφές αναγνώσιμες από μηχανή

Οι δείκτες είναι πεινασμένοι για γνώση! Ωστόσο, μπορούν να δεχτούν πληροφορίες μόνο σε μορφές αναγνώσιμες από μηχανή.

Υπάρχουν δύο τρόποι υποβολής πληροφοριών σε επιστημονικές βάσεις δεδομένων:

• μη αυτόματη εισαγωγή μεταδεδομένων άρθρου σε φόρμες κατάθεσης δεδομένων
• αποστολή μηχαναγνώσιμων αρχείων άρθρων σε ευρετήρια (για παράδειγμα, χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα σήμανσης και εγγραφής του Hephaestus DOI)

Εκτός αν δημιουργείτε αρχεία άρθρων με δυνατότητα ανάγνωσης από μηχανή, η μη αυτόματη καταχώριση είναι η μόνη επιλογή σας. Σε αυτήν την περίπτωση, η φόρμα λειτουργεί ως αγωγός για τη μετατροπή των δεδομένων του άρθρου που εισαγάγατε σε μεταδεδομένα αναγνώσιμα από υπολογιστή, τα οποία μπορεί να κατανοήσει το αποθετήριο.

Με βάση αυτό, η χειροκίνητη προσέγγιση είναι περιορισμένη. Δεν προσφέρουν όλες οι επιστημονικές βάσεις δεδομένων τη δυνατότητα μη αυτόματης εισαγωγής δεδομένων. Πολλά αποθετήρια, όπως το PubMed, θα δέχονται μόνο άρθρα που παρέχονται ως αρχεία XML. Σε περιπτώσεις όπου τα δεδομένα μπορούν να εισαχθούν χειροκίνητα και αυτή είναι μια επίπονη και δαπανηρή διαδικασία για τους εκδότες, είναι πολύ πιθανό να γίνουν χειροκίνητα σφάλματα εισαγωγής. Επιπλέον, οι επιστημονικές βάσεις δεδομένων απαιτούν εκτεταμένα μεταδεδομένα για ουσιαστική επεξεργασία των άρθρων, αλλά είναι απλώς αδύνατο να εισαχθούν χειροκίνητα όλα τα δεδομένα σωστά και χωρίς σφάλματα.

Με βάση αυτό, η χειροκίνητη προσέγγιση είναι περιορισμένη. Δεν προσφέρουν όλες οι επιστημονικές βάσεις δεδομένων τη δυνατότητα μη αυτόματης εισαγωγής δεδομένων. Πολλά αποθετήρια, όπως το PubMed, θα δέχονται μόνο άρθρα που παρέχονται ως αρχεία XML. Σε περιπτώσεις όπου τα δεδομένα μπορούν να εισαχθούν χειροκίνητα και αυτή είναι μια επίπονη και δαπανηρή διαδικασία για τους εκδότες, είναι πολύ πιθανό να γίνουν χειροκίνητα σφάλματα εισαγωγής. Επιπλέον, οι επιστημονικές βάσεις δεδομένων απαιτούν εκτεταμένα μεταδεδομένα για ουσιαστική επεξεργασία των άρθρων, αλλά είναι απλώς αδύνατο να εισαχθούν χειροκίνητα όλα τα δεδομένα σωστά και χωρίς σφάλματα.

Η δεύτερη επιλογή είναι να στείλετε αναγνώσιμα από μηχάνημα αρχεία επιστημονικών άρθρων. Αυτό είναι πολύ πιο γρήγορο για τους εκδότες καθώς εξαλείφει την ανάγκη για μη αυτόματη εισαγωγή δεδομένων. Τα αποθετήρια μπορούν να κατανοούν τα αρχεία άρθρου που είναι αναγνώσιμα από υπολογιστή ως έχουν. Τα αρχεία άρθρων με δυνατότητα ανάγνωσης από μηχανή παρέχουν επίσης καλύτερη ποιότητα ευρετηρίου επειδή περιέχουν πλούσια μεταδεδομένα. Το πρόγραμμα Hephaestus που αναπτύχθηκε από εμάς σας επιτρέπει να προετοιμάσετε ένα XML για το RSCI, το DOI, το AGRIS,το  DOAJ και για πολλά άλλα αποθετήρια, και επίσης στέλνει αυτόματα όλα τα δεδομένα του άρθρου στο BASE (να στείλω μια αίτηση για τη χρήση του προγράμματος Hephaestus για την εγγραφή DOI και την προετοιμασία xml).

Το eXtensible Markup Language, ή XML, είναι η τυπική γλώσσα σήμανσης που χρησιμοποιείται από ευρετήρια ακαδημαϊκών περιοδικών. Ας εξετάσουμε τις επιλογές για τη δημιουργία μηχαναγνώσιμων αρχείων άρθρων και την εισαγωγή τους σε επιστημονικές βάσεις δεδομένων.

Οι τρόποι δημιουργίας αρχείων άρθρου με δυνατότητα ανάγνωσης από μηχανή και υποβολή τους σε αποθετήρια

Υπάρχουν δύο επιλογές για τη δημιουργία μηχαναγνώσιμων επιστημονικών εγγράφων XML για ευρετηρίαση σε βάσεις δεδομένων. Τα αρχεία καταγραφής μπορούν να στέλνουν γενικά αρχεία XML ή αρχεία XML πλήρους κειμένου. Τα κοινά αρχεία XML περιέχουν βασικά μεταδεδομένα άρθρου, όπως:

• τίτλο περιοδικού
• εκδοτικό οίκο
• τίτλο άρθρου
• ονόματα συγγραφέων
• περίληψη άρθρου
• τα γενικά αρχεία XML μπορούν επίσης να περιλαμβάνουν άλλα πλούσια μεταδεδομένα, όπως το ORCID των συγγραφέων.

Όπως υποδηλώνει το όνομα, τα αρχεία άρθρου XML πλήρους κειμένου περιέχουν το πλήρες κείμενο του άρθρου σε γλώσσα αναγνώσιμη από μηχανή. Και οι δύο αυτές μορφές είναι καλύτερες από τη μη αυτόματη εισαγωγή δεδομένων. Το πλήρες κείμενο XML είναι η πιο αξιόπιστη επιλογή για ανάκτηση κειμένου και δεδομένων.

Όταν οι εκδότες συνεισφέρουν τόσο αρχεία πηγής όσο και πλήρους κειμένου XML στα αποθετήρια, συνήθως μπορούν να το κάνουν με έναν από τους δύο τρόπους: είτε να ανεβάσετε αρχεία άρθρου σε ευρετήρια σε παρτίδες (συνήθως μέσω διακομιστή FTP) ή να ρυθμίσετε αυτόματες μεταφορτώσεις άρθρων μέσω του API. Το API είναι ένα κανάλι που μπορούν να χρησιμοποιήσουν διάφορες εφαρμογές λογισμικού για να επικοινωνούν μεταξύ τους.

Όπως υποδηλώνει το όνομα, τα αρχεία άρθρου XML πλήρους κειμένου περιέχουν το πλήρες κείμενο του άρθρου σε γλώσσα αναγνώσιμη από μηχανή. Και οι δύο αυτές μορφές είναι καλύτερες από τη μη αυτόματη εισαγωγή δεδομένων. Το πλήρες κείμενο XML είναι η πιο αξιόπιστη επιλογή για ανάκτηση κειμένου και δεδομένων.

Όταν οι εκδότες συνεισφέρουν τόσο αρχεία πηγής όσο και πλήρους κειμένου XML στα αποθετήρια, συνήθως μπορούν να το κάνουν με έναν από τους δύο τρόπους: είτε να ανεβάσετε αρχεία άρθρου σε ευρετήρια σε παρτίδες (συνήθως μέσω διακομιστή FTP) ή να ρυθμίσετε αυτόματες μεταφορτώσεις άρθρων μέσω του API. Το API είναι ένα κανάλι που μπορούν να χρησιμοποιήσουν διάφορες εφαρμογές λογισμικού για να επικοινωνούν μεταξύ τους.

Το JATS DTD XML είναι η τυπική μορφή ευρετηρίου

Στην τεκμηρίωση σχετικά με την ευρετηρίαση σε επιστημονικές βάσεις δεδομένων, πιθανότατα έχετε συναντήσει τον όρο “JATS DTD” και ίσως αναρωτιέστε τι σημαίνει αυτό. Ενώ το XML είναι μια γλώσσα, το JATS DTD είναι ένας τύπος σύνταξης. Το JATS DTD σημαίνει «Ορισμός ετικέτας άρθρου περιοδικού» και «ορισμός τύπου εγγράφου». Είναι ένας ειδικός τρόπος μορφοποίησης αρχείων XML που αναπτύχθηκε από το National Information Standards Organization (NISO). Το JATS DTD θεωρείται το τεχνικό πρότυπο για άρθρα περιοδικών και προτιμάται ή απαιτείται για πολλά ακαδημαϊκά ευρετήρια, συμπεριλαμβανομένων όλων των δεικτών του National Library of Medicine

(NLM) – PubMed, PubMed Central και MEDLINE.

Η μορφοποίηση άρθρων σε JATS DTD XML είναι η βέλτιστη πρακτική και θα σας επιτρέψει να προσθέσετε γρήγορα και εύκολα άρθρα περιοδικών σε ευρετήρια. Το RADS παρέχει μια υπηρεσία για την επιλογή και εγκατάσταση πλατφορμών δημοσίευσης που θα βοηθήσουν τη δημοσίευσή σας να παρέχει άρθρα σε μηχαναγνώσιμη μορφή.